В игре есть три различные финальные сцены, каждая из которых показывает альтернативные события в мире, в зависимости от действия игрока в финале игры. Действие игрока в процессе игры на финал никак не влияют.
1. Хорошая. Ренко убивает себя во время спасения Демичева 26 октября 1955 года.
Ренко снова летит в вертолете, как в начале игры. Но вместо статуи серпа стоит статуя Барисова с МВП на руке, а вертолёты группы разведки украшены советской символикой и уже нет сообщения о вторжении в воздушное пространство России. Неожиданно приказ о высадке отменяют. Девлин сетует на разведку и обращается к Ренко: «Ну, что я говорил? Ничего интересного здесь быть не может. Верно, товарищ?»
2. Плохая. Ренко убивает Барисова 27 октября 2010 года.
Ренко и Демичев захватили весь мир и разделили влияние, но вскоре начали вражду друг с другом. Ренко руководит всем миром, кроме США, где обосновался Демичев. Разрабатывая новый вид МВП, Демичев готовится к новому противостоянию с Ренко.
3. Нейтральная. Ренко сначала убивает Демичева, затем Барисова 27 октября 2010 года.
Ренко скрывается из лаборатории так, что больше его никто не увидел. Советская Империя без Демичева рушится на множество мелких государств, начинаются локальные войны. Остров взрывается с феноменальной силой, мутации вырываются на свободу. Тем временем таинственный незнакомец с возможностями МВП оккупирует США, начинается постройка новой империи.
Если игрок слишком долго раздумывает над выбором, то Демичев подберет револьвер и застрелит Ренко.