Морская составляющая, появившаяся в предыдущих проектах, в Assassin's Creed Rogue была улучшена. У врагов появилась новая тактика - они могут идти на абордаж. У вас будет корабль под названием Морриган. Шэй сможет использовать новое оружие для суши (пневматическая винтовка, особые гранаты) и моря (горящая нефть, puckle gun - пушки с барабанами). Вы сможете расстреливать айсберги. С помощью орлиного зрения нужно будет обнаруживать скрывающихся в толпах и на крышах ассасинов.